Реконструкция изменений кариотипа одной клетки при колоректальном раке позволяет выявить прерывистые и постепенные модели диверсификации

27.01.2022 - 12:26 11
Реконструкция изменений кариотипа одной клетки при колоректальном раке позволяет выявить прерывистые и постепенные модели диверсификации

Yannik Bollen, Ellen Stelloo, […]Hugo J. G. Snippert
Nature Genetics volume 53, pages1187–1195 (2021)

Центральное место в эволюции опухолей занимает генерирование генетического разнообразия. Однако степень и характер изменений кариотипа de novo, возникающих и распространяющихся в опухолях человека, недостаточно хорошо изучены, особенно при одноклеточном разрешении. Здесь мы представляем 3D Live-Seq - протокол, который объединяет визуализацию живых клеток при росте опухолевого органоида и полногеномное секвенирование каждой клетки с целью реконструкции эволюционирующих кариотипов опухолевых клеток в последовательных поколениях клеток. Используя органоиды опухоли при колоректальном раке, полученной от пациентов, и свежие биопсии опухоли, мы продемонстрировали, что изменения кариотипа различной сложности широко распространены и могут возникать в течение нескольких поколений клеток. Субхромосомные ацентрические фрагменты были склонны к репликации и коллективной неправильной сегрегации в ходе последовательных клеточных делений. В отличие от этого, грубые геномные изменения кариотипа возникали при одном ошибочном клеточном делении, что подтверждает возможность развития анеуплоидных опухолевых геномов путем прерывистой эволюции. Картирование временной динамики и закономерностей диверсификации кариотипа в раке позволяет реконструировать эволюционные пути к злокачественной пригодности.

Комментарии

    Отправить

    Тематики

    COVID-19 Гастроэзофагеальная рефлюксная болезнь Грыжа пищеводного отверстия диафрагмы Грыжи белой линии живота Диастаз прямых мышц живота Латеральная лимфодиссекция Метастатическое поражение печени Паховые грыжи Послеоперационные грыжи Рак желудка Рак поджелудочной железы Анальная трещина Анальные кондиломы Анальный зуд Болезнь Крона Воспалительные заболевания кишечника Выпадение прямой кишки Геморрой Грыжи передней брюшной стенки Дивертикулез Дивертикулит Дисфункция тазового дна Запор Кишечные стомы Колоректальный рак Лазер в проктологии Недержание кала Онкоколопроктология Операции Острый перианальный венозный тромбоз Парапроктит Полипы толстой кишки Проктология Пролапс тазового дна Рак анального канала Рак ободочной кишки Рак прямой кишки Рак толстой кишки Ректальный пролапс Свищи прямой кишки Эпителиальный копчиковый ход Эндометриоз Хирургия Язвенный колит