Маркер стволовых клеток KLF5 регулирует CCAT1 через трехмерную структуру генома в клетках колоректального рака

07.04.2022 - 14:10 22
Маркер стволовых клеток KLF5 регулирует CCAT1 через трехмерную структуру генома в клетках колоректального рака

Абстракт
Введение
KLF5 играет решающую роль в стволовых клетках толстой кишки в сотрудничестве с геном Lgr5. В этом исследовании мы стремились объяснить механизм регуляции продукта гена KLF5 с точки зрения трехмерной структуры генома при колоректальном раке (CRC).

Методы
Сконструированный in vitro метод иммунопреципитации хроматина, опосредованный ДНК-связывающей молекулой (enChIP) -seq, был использован для идентификации областей, которые связываются с промотором KLF5.

Результаты
Мы обнаружили, что промоторная область KLF5 взаимодействует с энхансерной областью KLF5, а также с областью сайта начала транскрипции (TSS) гена транскрипта 1, ассоциированного с раком толстой кишки (CCAT1). Примечательно, что гетероделеционные мутанты энхансера KLF5 нарушали раковые стволовые свойства клеток CRC. Белок KLF5 участвует в основной регуляторной схеме вместе с кофакторами (BRD4, MED1 и RAD21), которые конструируют трехмерные структуры генома, состоящие из промотора KLF5, энхансера и TSS-области CCAT1. Анализ in vitro показал, что KLF5 регулирует экспрессию CCAT1, и мы обнаружили, что экспрессия CCAT1 сильно коррелировала с экспрессией KLF5 в клинических образцах CRC.

Выводы
Наши данные предлагают механистическое понимание того, что белок KLF5 конструирует ядро-регуляторную схему с кофакторами в трехмерной структуре генома и координирует экспрессию KLF5 и CCAT1 в CRC.

A stem cell marker KLF5 regulates CCAT1 via three-dimensional genome structure in colorectal cancer cells. Takashi Takeda, Yuhki Yokoyama, Hidekazu Takahashi, Daisuke Okuzaki, Kaho Asai, Hiroaki Itakura, Norikatsu Miyoshi, Shogo Kobayashi, Mamoru Uemura, Toshitsugu Fujita, Hiroo Ueno, Masaki Mori, Yuichiro Doki, Hodaka Fujii, Hidetoshi Eguchi, Hirofumi Yamamoto.

British Journal of Cancer (2021)

Комментарии

    Отправить

    Тематики

    COVID-19 Гастроэзофагеальная рефлюксная болезнь Грыжа пищеводного отверстия диафрагмы Грыжи белой линии живота Диастаз прямых мышц живота Латеральная лимфодиссекция Метастатическое поражение печени Паховые грыжи Послеоперационные грыжи Рак желудка Рак поджелудочной железы Анальная трещина Анальные кондиломы Анальный зуд Болезнь Крона Воспалительные заболевания кишечника Выпадение прямой кишки Геморрой Грыжи передней брюшной стенки Дивертикулез Дивертикулит Дисфункция тазового дна Запор Кишечные стомы Колоректальный рак Лазер в проктологии Недержание кала Онкоколопроктология Операции Острый перианальный венозный тромбоз Парапроктит Полипы толстой кишки Проктология Пролапс тазового дна Рак анального канала Рак ободочной кишки Рак прямой кишки Рак толстой кишки Ректальный пролапс Свищи прямой кишки Эпителиальный копчиковый ход Эндометриоз Хирургия Язвенный колит