Изучение соматического мутационного ландшафта T4N0: сравнительный анализ II и III стадий рака ободочной кишки
Введение
Одним из аспектов патогенеза рака ободочной кишки является феномен «парадокса выживаемости» между T4N0 (стадия II) и anyTN1 (стадия III) раком. Существует ограниченное количество геномных исследований, объясняющих, почему заболевание T4N0 считается более прогностически неблагоприятным, чем рак III стадии.
Цель
Провести комплексное исследование геномных особенностей рака ободочной кишки T4N0 и выявить отличия от опухолей T123N0 и anyTN1 на основе данных о соматических мутациях.
Дизайн
Ретроспективное исследование соматических мутаций и их прогностического влияния на выживаемость.
Место проведения
Анализ выполнен с использованием базы данных The Cancer Genome Atlas и портала National cBioPortal for Cancer Genomics.
Пациенты
Образцы были стратифицированы в зависимости от стадирования по системе TNM: группы T4N0, T123N0 и anyTN1.
Основные оцениваемые показатели
Частота мутаций между группами сравнивалась с использованием критерия Фишера при p ≤ 0,05. Был выполнен анализ путей для картирования биологических сетей, обогащенных соматическими мутациями. Анализировались взаимодействия соматических мутаций и проводилась проверка результатов методом анализа выживаемости по Каплану-Мейеру на независимых выборках.
Результаты
Были выявлены 30 генов с достоверно различающейся частотой мутаций, уникальных для опухолей T4N0 по сравнению с T123N0 и anyTN1. Среди них гены DIDO1, CACNA1B и ALMS1 демонстрировали сочетание соматических мутаций с другими мутировавшими генами. Анализ сигнальных путей показал, что сигнальные каскады, связанные с эфринами B, оксидом азота и кальцием, обогащены мутациями и играют роль в патогенезе T4N0 опухолей. Результаты были подтверждены анализом выживаемости.
Ограничения
Ретроспективный характер исследования и ограниченное количество пациентов.
Выводы
В опухолях T4N0 выявлены характерные паттерны соматических мутаций, отсутствующие в опухолях T123N0 и anyTN1. Анализ взаимодействия мутаций подчеркнул роль DIDO1, CACNA1B и ALMS1 в патогенезе T4N0, при этом мутации в этих генах обладали значительным прогностически неблагоприятным потенциалом. Среди них мутации в DIDO1 ассоциировались с ухудшением выживаемости.
Источник: Otohinoyi D, Pavleszek KE, Dooley DA, Carr BT, Mabry TL, Hicks C, Nfonsam VN. Exploring the Somatic Mutation Landscape of T4N0: A Comparative Perspective on Late Stage II and Stage III Colon Cancer. Dis Colon Rectum. 2025 Jul 1;68(7):845-854. doi: 10.1097/DCR.0000000000003721. Epub 2025 Apr 7. PMID: 40192132.